研究室のUSL-5Pの状況を確かめてみたら、kernel2.6が入っていました。どうも今回入れたのは前回と違うようです。
http://senta.s112.xrea.com/senta/Tips/000/4f/
上のサイトをもとにしたようです。もう一度インストールしなおしました。dual環境は不要なのでkernel2.6のシステムだけを組み込んでいます。
最初の起動がうまくいかず少々焦ったのですが、/etc/fstabのルートのデバイスが間違っていたためでした。(dual環境とパーティションがずれていた)
samba/swatをインストールし、現在はnetatalkのビルド中です。